MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus chromosome

Total Repeats: 89487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010407	CCGAC	2	10	14	23	20 %	0 %	20 %	60 %	170780463
2	NC_010407	CGC	2	6	48	53	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780463
3	NC_010407	GAC	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780463
4	NC_010407	CGC	2	6	77	82	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780463
5	NC_010407	TCA	2	6	95	100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780463
6	NC_010407	TGA	2	6	122	127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170780463
7	NC_010407	AGC	2	6	179	184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780463
8	NC_010407	CGA	2	6	222	227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780463
9	NC_010407	GGC	2	6	228	233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780463
10	NC_010407	GTG	2	6	256	261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170780463
11	NC_010407	CGG	2	6	305	310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780463
12	NC_010407	AGC	2	6	311	316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780463
13	NC_010407	CGG	2	6	432	437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780463
14	NC_010407	CGC	3	9	456	464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780463
15	NC_010407	GTCGCC	2	12	466	477	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	170780463
16	NC_010407	CCT	2	6	543	548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780463
17	NC_010407	GGA	2	6	612	617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780463
18	NC_010407	TCA	2	6	632	637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780463
19	NC_010407	AAC	2	6	649	654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170780463
20	NC_010407	GTC	2	6	657	662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780463
21	NC_010407	TCC	2	6	695	700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780463
22	NC_010407	CGA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780463
23	NC_010407	TCC	2	6	719	724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780463
24	NC_010407	AGG	2	6	743	748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780463
25	NC_010407	CTT	2	6	750	755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170780463
26	NC_010407	CAA	2	6	783	788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170780463
27	NC_010407	GGT	2	6	792	797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170780463
28	NC_010407	GCC	2	6	813	818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780463
29	NC_010407	TCA	2	6	872	877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780463
30	NC_010407	AAG	2	6	925	930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170780463
31	NC_010407	GAC	2	6	958	963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780463
32	NC_010407	CCA	2	6	980	985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780463
33	NC_010407	CAT	2	6	1140	1145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780463
34	NC_010407	CCG	2	6	1154	1159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780463
35	NC_010407	CGA	2	6	1179	1184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780463
36	NC_010407	CTC	2	6	1194	1199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780463
37	NC_010407	ACG	2	6	1309	1314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780463
38	NC_010407	CAA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170780463
39	NC_010407	CGC	2	6	1357	1362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780463
40	NC_010407	ACC	2	6	1409	1414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780463
41	NC_010407	GCT	2	6	2034	2039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780464
42	NC_010407	GCG	2	6	2069	2074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780464
43	NC_010407	GGAC	2	8	2094	2101	25 %	0 %	50 %	25 %	170780464
44	NC_010407	GTC	2	6	2109	2114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780464
45	NC_010407	GC	3	6	2134	2139	0 %	0 %	50 %	50 %	170780464
46	NC_010407	GAG	2	6	2161	2166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780464
47	NC_010407	CAC	2	6	2241	2246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780464
48	NC_010407	GGA	2	6	2247	2252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780464
49	NC_010407	GCT	2	6	2292	2297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780464
50	NC_010407	GAG	2	6	2311	2316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780464
51	NC_010407	CTC	2	6	2353	2358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780464
52	NC_010407	CGC	3	9	2373	2381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780464
53	NC_010407	GTCGCC	2	12	2392	2403	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	170780464
54	NC_010407	GAC	2	6	2413	2418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780464
55	NC_010407	TCA	2	6	2429	2434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780464
56	NC_010407	ACCG	2	8	2482	2489	25 %	0 %	25 %	50 %	170780464
57	NC_010407	CGG	2	6	2523	2528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780464
58	NC_010407	ACG	2	6	2536	2541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780464
59	NC_010407	CGA	2	6	2643	2648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780464
60	NC_010407	AAG	2	6	2677	2682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170780464
61	NC_010407	CTG	2	6	2695	2700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780464
62	NC_010407	CCG	2	6	2716	2721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780464
63	NC_010407	TCA	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780464
64	NC_010407	CGC	2	6	2794	2799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780464
65	NC_010407	GCC	2	6	2824	2829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780464
66	NC_010407	CTTCAC	2	12	2835	2846	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	170780464
67	NC_010407	CCT	2	6	2913	2918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780464
68	NC_010407	GTG	2	6	2935	2940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170780464
69	NC_010407	CTG	2	6	2959	2964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780464
70	NC_010407	CAA	2	6	3027	3032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170780464
71	NC_010407	TCA	2	6	3047	3052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780464
72	NC_010407	TCC	2	6	3061	3066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780464
73	NC_010407	CTG	2	6	3100	3105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780464
74	NC_010407	CTG	3	9	3115	3123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780464
75	NC_010407	GTTG	2	8	3244	3251	0 %	50 %	50 %	0 %	170780465
76	NC_010407	GCGG	2	8	3334	3341	0 %	0 %	75 %	25 %	170780465
77	NC_010407	CG	3	6	3354	3359	0 %	0 %	50 %	50 %	170780465
78	NC_010407	TGA	2	6	3421	3426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170780465
79	NC_010407	CGC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780465
80	NC_010407	GGAT	2	8	3513	3520	25 %	25 %	50 %	0 %	170780465
81	NC_010407	CCGCGG	2	12	3582	3593	0 %	0 %	50 %	50 %	170780465
82	NC_010407	GCC	2	6	3623	3628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780465
83	NC_010407	TCCG	2	8	3629	3636	0 %	25 %	25 %	50 %	170780465
84	NC_010407	TCC	2	6	3640	3645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780465
85	NC_010407	CTT	2	6	3650	3655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170780465
86	NC_010407	GATCA	2	10	3668	3677	40 %	20 %	20 %	20 %	170780465
87	NC_010407	CGG	2	6	3761	3766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780465
88	NC_010407	CCCG	2	8	3840	3847	0 %	0 %	25 %	75 %	170780465
89	NC_010407	GC	3	6	3979	3984	0 %	0 %	50 %	50 %	170780465
90	NC_010407	CG	3	6	4008	4013	0 %	0 %	50 %	50 %	170780465
91	NC_010407	CGA	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780465
92	NC_010407	TCC	2	6	4035	4040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780465
93	NC_010407	ACC	2	6	4041	4046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780465
94	NC_010407	CGC	2	6	4047	4052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780465
95	NC_010407	GAG	2	6	4055	4060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780465
96	NC_010407	TCG	2	6	4237	4242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780466
97	NC_010407	GC	5	10	4268	4277	0 %	0 %	50 %	50 %	170780466
98	NC_010407	CGA	2	6	4346	4351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780466
99	NC_010407	CGC	3	9	4355	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170780466
100	NC_010407	C	6	6	4372	4377	0 %	0 %	0 %	100 %	170780466
101	NC_010407	CGGC	2	8	4399	4406	0 %	0 %	50 %	50 %	170780466
102	NC_010407	GTG	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170780466
103	NC_010407	CG	3	6	4436	4441	0 %	0 %	50 %	50 %	170780466
104	NC_010407	CGG	2	6	4472	4477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780466
105	NC_010407	CGA	2	6	4493	4498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780466
106	NC_010407	TCG	2	6	4540	4545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780466
107	NC_010407	GCG	2	6	4561	4566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780466
108	NC_010407	CGG	2	6	4601	4606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780466
109	NC_010407	GC	3	6	4625	4630	0 %	0 %	50 %	50 %	170780466
110	NC_010407	GAG	2	6	4671	4676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780466
111	NC_010407	ATG	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170780466
112	NC_010407	CTC	2	6	4779	4784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780466
113	NC_010407	GCG	2	6	4785	4790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780466
114	NC_010407	CAT	2	6	4799	4804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170780466
115	NC_010407	GTC	2	6	4848	4853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780466
116	NC_010407	GCT	2	6	4862	4867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780466
117	NC_010407	AGG	2	6	4891	4896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780466
118	NC_010407	GAG	2	6	4959	4964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780466
119	NC_010407	CG	3	6	5012	5017	0 %	0 %	50 %	50 %	170780466
120	NC_010407	TCC	2	6	5022	5027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780466
121	NC_010407	AGG	2	6	5032	5037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780466
122	NC_010407	CGG	2	6	5081	5086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780466
123	NC_010407	AGA	2	6	5098	5103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170780466
124	NC_010407	ACC	2	6	5111	5116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170780466
125	NC_010407	GAT	2	6	5118	5123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170780467
126	NC_010407	CGTC	2	8	5124	5131	0 %	25 %	25 %	50 %	170780467
127	NC_010407	CG	3	6	5164	5169	0 %	0 %	50 %	50 %	170780467
128	NC_010407	GGGCA	2	10	5215	5224	20 %	0 %	60 %	20 %	170780467
129	NC_010407	TGG	2	6	5234	5239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170780467
130	NC_010407	GCT	2	6	5334	5339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780467
131	NC_010407	ACGGC	2	10	5411	5420	20 %	0 %	40 %	40 %	170780467
132	NC_010407	CG	3	6	5429	5434	0 %	0 %	50 %	50 %	170780467
133	NC_010407	GCG	2	6	5492	5497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170780467
134	NC_010407	GTCGG	2	10	5502	5511	0 %	20 %	60 %	20 %	170780467
135	NC_010407	GCT	2	6	5517	5522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780467
136	NC_010407	GCT	2	6	5529	5534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780467
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143	NC_010407	TGG	2	6	5720	5725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170780467
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168	NC_010407	CG	3	6	6449	6454	0 %	0 %	50 %	50 %	170780468
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170	NC_010407	TCC	2	6	6561	6566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170780468
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260	NC_010407	GCT	2	6	9948	9953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780470
261	NC_010407	GC	3	6	9986	9991	0 %	0 %	50 %	50 %	170780470
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263	NC_010407	GTC	2	6	10060	10065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170780470
264	NC_010407	GAG	2	6	10072	10077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170780470
265	NC_010407	CGA	2	6	10200	10205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780470
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271	NC_010407	CGAGGC	2	12	10437	10448	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	170780470
272	NC_010407	CGA	2	6	10494	10499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780470
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280	NC_010407	CGA	2	6	10764	10769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170780470
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285	NC_010407	CAGC	2	8	10899	10906	25 %	0 %	25 %	50 %	170780470
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